Kruishoutem bestaat naast Kruishoutem-centrum en het gehucht Marolle nog uit de deelgemeenten Nokere en Wannegem-Lede en verder het dorp Lozer dat in 1977 door Huise aan Kruishoutem werd afgestaan. Wannegem-Lede zelf bestaat uit de hoofdkern Wannegem en het gehucht Lede in het oosten van de deelgemeente. De huidige neogotische Sint-Eligiuskerk werd voltooid in 1855 naar een ontwerp van architect Croquison. Hij kwam er in de plaats van de romaanse kerk die in 1463 werd vergroot met een gotisch koor. Eind 16e eeuw kwam er de teruggebouwde kruisingstoren.